تشمل كلية العلوم الطبية التطبيقية ثمانية أقسام وهي:
o قسم صحة المجتمع
o قسم صحة الأسنان
o قسم طب المختبرات
o قسم التمريض
o قسم البصريات
o قسم التأهيل الطبي
o قسم الأشعة
o قسم التقنيات السريرية
وتقدم كلية العلوم الطبية التطبيقية حالياً 5 برامج تخصصية :
